1934年6月9日，南京日本總領事館揚言「應由中國政府負完全責任，如藏本無生還之希望，日方將撒回僑民、發動自衛」。

南京國民政府立即下令警察、憲兵全體出動，全力搜查。

警察廳長陳焯派督察長陳獨真前往日本領事館多方調查，瞭解藏本英明平時的個性、嗜好、身材、服飾等細節，同時索取藏本照片，翻印多張，分別向藏本平日來往各處及城關站埠四出查訪，又將從日本領事館至陰陽營藏本寓所以及自領事館至下關一帶沿路崗警，逐一查問，仍沒有找到線索。

同日，陳焯召集各局、隊、所負責人，研究擴大調查辦法，明確各部責任。

日本方面抓住此事大做文章，認定「藏本失蹤」是「反日陰謀」，日本外務當局聲稱「此次事件係‘拳匪事件’，是杉山書記被殺以來最重大之事件，對於南京當局決要求嚴重之措置，並絕對採取強硬態度」，大造戰爭輿論。

蔣中正悉情後，電令：「南京全城戒嚴72小時，3天之內務必尋獲藏本，違令者殺」。

國民政府官方如熱鍋螞蟻，軍、警、憲、特投入了搜查特別行動之中，準備發動全南京幾十萬人，搜遍全城角落，尋找藏本英明。

6月10 日，日本官方報紙大肆進行惡意宣傳，大阪《每日新聞》稱：「目下南京對於日本官兵之壓迫，非常識之至，中國憲兵隊針對日本人，皆有便衣偵探跟隨，電話亦一一竊聽。」

6月11 日，南京警察廳又在督察處召集各主管人員報告連日查訪經過，研究繼續偵查辦法，命令各警，不分晝夜，努力查找，以便儘快找出線索，尋得藏本下落。

日本外相廣田弘毅認為南京政府對於「藏本失蹤案」的調查缺乏誠意，致電日本駐南京總領事須磨，訓示與南京政府交涉的3條原則：1、在中國首都發生的外國使館人員失蹤事件，在經過數小時後，仍然未能判明事件的真相與責任之所在，這是近代國家從來沒有過的事件；2、南京政府如果確實沒有調查事件真相的能力，那麼日本政府就不得不為保護公使館員生命財產的安全而加以‘重大考慮’；3、向南京政府要求迅速解決此案，如果有故意拖延放鬆調查的情況，日本政府將提出‘重大抗議’。

同日，警備司令部在南京各家報紙刊登大幅廣告，懸賞尋人，宣佈「無論何人，如能將該副領事藏本英明氏直接尋獲，賞洋1萬元，能知該副領事蹤跡，報告本廳部因而尋獲者，賞洋5千元」。

日方除向中國政府交涉外，並將在上海的日本憲兵派往南京，日本軍方亦磨刀霍霍，陸續將第3艦隊27隊的驅逐艦「葦號」、巡洋艦「對馬號」等軍艦從上海開赴下關江邊，卸掉炮衣的炮口對準古城，箭在弦上，一觸即發。斯時，南京城風聲鶴唳，草木皆兵；下關居民已扶老攜幼，離家逃難。

晚上，警察廳與警備司令部召開聯席會議，議決幾項緊急方案：南京四郊的搜查，由憲兵警察聯合編成9組，共同搜尋；實行戶口總檢查；派便衣隊攜帶照片四出查訪；請江寧縣政府協助查找；派人分別向蘇州、無錫、鎮江等處搜尋。

然而，歷時近2個晝夜逐戶大搜查的結果，仍然音訊杳無。

6月12日，國民政府行政院召開緊急會議，對「藏本失蹤案」進行長時間的討論，並下令督促警備司令部和警察廳嚴密搜查。

在江西前線指揮剿共的蔣中正也致電行政院長兼外交部長的汪精衛，詳細詢問了藏本案的情況，並下令軍警嚴查。

下午3 點，日總領事須磨、使館參贊有野與汪精衛會談，要求迅速查明藏本行止，藏本行止不明及因此發生的一切後果，當然由中方擔負；這一要求只是第一步方案，倘若中方仍然沒有誠意，那麼將實施第二、第三步方案。

當天，日本媒体也發起了猛烈的輿論攻勢。

《東京新聯社》通電說，日本政府認為「藏本失蹤案」是義和拳運動中杉山書記官被殺以來的又一個重大事件，對南京政府應絕對採取強硬態度。

《朝日新聞》社論說，「藏本事件」是因為有人企圖破壞中日關係的好轉而採取這一行動；南京政府對此難辭其責任，南京報紙所作的自殺等類的推測，不過是為了混淆視聽。

此外，駐留南京的日本人也公開集會，揚言如果這一事件不能迅速解決，全體日本人將退出南京。

日方的威逼恐嚇，使南京政府壓力倍增，一面要求日方保持鎮靜，一面下令嚴密查訪，‘如有怠忽，定當從嚴懲處，決不寬貸’。

外交部、警備司令部和警察廳為了便於查找，決定各派1人組成聯絡組，交換情報並決定第2天的行動計畫。並向各區警察指示搜查標準為：1、形跡可疑者；2、方言不通者；3、面貌奇異者；4、似有神經病狀態者。凡上述四種人，皆須注意。

一時，南京全城鼎沸起來，卻始終沒有發現藏本的蹤跡。

南京政府連日努力，竟然找不到一絲線索，在真相未明的情況下，日方妄加揣測，步步進迫，通過各種手段，向南京政府施加壓力。

午夜，日本駐華大使館交付南京國民政府一份殺氣騰騰的通牒，以咄咄逼人的橫蠻氣勢，武斷地指控：「日本駐京總領事館藏本英明失蹤，中國方面負有不可推卸的責任……」云云。限令中國官方在3日之內交出藏本，不然將訴諸‘武力’，在南京實行搜查，同時通知日僑在3日內撤離南京。

隨後，日海軍部下令將「長門號」、「陸奧號」等20多艘軍艦從上海吳淞口調來南京，雲集浦口、下關之間的長江主航道江面。

6月13日，《每日新聞》更將「藏本失蹤案」捏造得繪聲繪色，真像煞有「陰謀」一般；顯然，日本軍國主義者企圖以此為口實，挑起衝突，擴大對中國的侵略。

6月13日清晨5點多，「明孝陵陵園管理處」工頭張燕亭起身小解，門外有一個人走來向他要水喝；這人蓬頭垢面，穿著沾有泥土的西裝，形容疲憊。張燕亭感到可疑，聯想起近日報載藏本‘失蹤’的事，頓時警惕起來。張燕亭給他倒了杯水，該人喝了水以後，道了聲謝謝，轉身出門向山上走去。

張燕亭立即叫陵園工人郝正林、魏宗青跟蹤上山，看住那個人，自己立刻跑到陵園辦公室打電話，通知警察廳，趕快派人前來辯認。

上午9時許，已3晝夜未合眼的首都警察廳調查課長趙世瑞帶領搜查人員趕至中山陵，於紫金山洞中尋獲藏本，而藏本英明為了所謂的‘光榮使命’，不肯下山，經苦口婆心，再三勸駕，始行登車，這時已是下午2點多了。

回到首都警察廳後，通過有關照片資料驗證，確信其為藏本英明無誤。

警廳廳長陳焯、外交部亞洲司司長沈覲鼎、情報司司長李迪俊、警備司令谷正倫、行政院秘書長褚民誼、參謀本部廳長徐培根等人此時都已得到消息，在廳長辦公室裡等待；他們大都與藏本在官場多次見面，彼此相識。

狼狽的藏本英明在眾人面前陳述自己這幾天的遭遇時，竟激動得哭了起來。

當晚，國民政府外交部正式邀請各國駐華使節及中外記者舉行盛大的新聞發佈會。會上，外交部長唐有任宣佈尋獲藏本英明，並當場移交總領事館；日本駐華大使有田吉等人在大庭廣眾面前見到藏本活口，震驚得手足無措。

一群中外記者蜂擁而上，將日方人員團團圍住，藏本守口如瓶，拒不回答任何提問；有田則吞吞吐吐，答非所問：「藏本因神經錯亂而導致走失……」。

6月15日午夜，記者會草草收場，至此，「藏本失蹤案」真相大白。

日本在全世界面前出了個大大的洋相，竟謊稱‘藏本身心俱缺乏平靜，陳述亦不明嘹確實，故關於今後之措置，俟藏本回復後，調查事情，再行考慮’，企圖經過一段時間後，推翻原詞。但是，藏本英明始終堅持自己抑鬱、意圖自殺的說法，粉碎了日方正在醞釀的、更大規模的‘攻勢’。

「藏本失蹤案」一場虛驚，化險為夷，就這樣不了了之了。

6月20日，藏本英明一家在軍方和外交人員的押送下離開南京，從上海乘船返回日本，自此人間蒸發，再無音訊。

歷史影響：

抗日戰爭前，日本帝國主義製造所謂‘失蹤’事件，在中國已屢見不鮮，這是強鄰壓境慣用的訛詐伎倆，以便為侵略中國尋找藉口，「藏本失蹤案」只是其中之一，是日本意圖發動侵華戰爭的一個鬧劇。

3年後，1937年，日軍還是以士兵失蹤為藉口，在盧溝橋挑起了對華的全面戰爭。

（資料來源，參考：百度百科、每日頭條、歷史之家、新浪網）